Ova tvrđava pripada najjačim pomorskim fortifikacijama na hrvatskoj obali Jadrana. Tvrđava Sv. Nikole izgrađena je nakon pada grada Skradina pod navalom Turaka 1522. godine. Osvajanje Skradina Turcima je omogućilo povoljan položaj za ostvarivanje pomorske veze s osvojenim teritorijem u unutrašnjosti. Grad i luka Šibenik bili bi u slučaju ostvarenja njihovog cilja ugroženi. Sama luka grada je bila koliko toliko sigurna , ali jedini ulaz u grad s morske strane bio je moguć samo kroz uski kanal Sv. Ante pa se mjesto nove utvrde nametnulo samo po sebi. Šibenik je tada zatražio pomoć od Mletačke Republike koja istu nije odbila jer se smatralo da onaj tko drži Šibenik drži i veći dio tog dijela Jadrana.